防治水稻黑条矮缩病要治早，播种的时候要用吡虫啉、吡蚜酮等拌种，然后秧苗期及水稻生长前期都要做好传毒昆虫白背飞虱的防治，做好“控虱防矮”工作。至于现在治病的药剂，暂时无很好的药剂。有一些健身栽培措施如喷施叶面肥等，有一点症状缓解的作用。